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本期向大家介绍一款蛋白/核酸结构快速渲染(卡通风格)的小工具——illustrate。放心!本期完全不涉及代码,不折腾人,请放心食用。

结构渲染效果示例如下:

PDB ID: 1ttt

该小工具适用绘制蛋白或复合物整体轮廓,但不适合用来绘制残基侧链的相互作用。illustrate绘制的风格是我本人非常喜欢的“卡通风”。尽管Chimera也可以实现此功能,但毕竟还是要费些功夫的。illustrate则可以一键出图,丝滑~。

操作视频

网站地址:
https://ccsb.scripps.edu/illustrate/

3月22日

操作流程(文字版)

  1. 1. 前往https://ccsb.scripps.edu/illustrate/网站,滑动到页面最下方:

 

  1. 2. 你可以选择点击选择文件按钮上传pdb文件,也可以直接输入pdb id直接调用数据库中的结构。这里我选择了直接输入pdb id为1ttt的结构。输入之后稍等片刻右侧视图框会出现蛋白图像。

  2. 3. 调整蛋白朝向。

  • • 旋转:拖动鼠标左键;

  • • 放大/缩小:滑动鼠标滚轮

  • • 移动位置:ctrl+拖动鼠标左键

  1. 4. 点击按键illustrate绘制
    根据绘制的蛋白大小需要等待的时间也长短不一,耐心等一会儿。

 


5. 保存图片到本地
点击最右侧渲染出的图片会跳转新的网页,右键保存到本地。

 

本期向大家介绍一款蛋白/核酸结构快速渲染(卡通风格)的小工具——illustrate。放心!本期完全不涉及代码,不折腾人,请放心食用。

结构渲染效果示例如下:

PDB ID: 1ttt

该小工具适用绘制蛋白或复合物整体轮廓,但不适合用来绘制残基侧链的相互作用。illustrate绘制的风格是我本人非常喜欢的“卡通风”。尽管Chimera也可以实现此功能,但毕竟还是要费些功夫的。illustrate则可以一键出图,丝滑~。

操作视频

网站地址:
https://ccsb.scripps.edu/illustrate/

3月22日

操作流程(文字版)

  1. 1. 前往https://ccsb.scripps.edu/illustrate/网站,滑动到页面最下方:

 

  1. 2. 你可以选择点击选择文件按钮上传pdb文件,也可以直接输入pdb id直接调用数据库中的结构。这里我选择了直接输入pdb id为1ttt的结构。输入之后稍等片刻右侧视图框会出现蛋白图像。

  2. 3. 调整蛋白朝向。

  • • 旋转:拖动鼠标左键;

  • • 放大/缩小:滑动鼠标滚轮

  • • 移动位置:ctrl+拖动鼠标左键

  1. 4. 点击按键illustrate绘制
    根据绘制的蛋白大小需要等待的时间也长短不一,耐心等一会儿。

 


5. 保存图片到本地
点击最右侧渲染出的图片会跳转新的网页,右键保存到本地。

 

本文标签: 核酸小工具蛋白卡通风格